Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx12Q9ER00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx12Q9ER00 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx12Q9ER00 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx12Q9ER00 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stx12Q9ER00 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stx12Q9ER00 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx12Q9ER00 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Stx12Q9ER00 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx12Q9ER00 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx12Q9ER00 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx12Q9ER00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx12Q9ER00 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stx12Q9ER00 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx12Q9ER00 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms