Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col4a3bpQ9EQG9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col4a3bpQ9EQG9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col4a3bpQ9EQG9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col4a3bpQ9EQG9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col4a3bpQ9EQG9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col4a3bpQ9EQG9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col4a3bpQ9EQG9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col4a3bpQ9EQG9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col4a3bpQ9EQG9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Col4a3bpQ9EQG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Col4a3bpQ9EQG9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a3bpQ9EQG9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Col4a3bpQ9EQG9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Col4a3bpQ9EQG9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Col4a3bpQ9EQG9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Col4a3bpQ9EQG9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms