Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tspan4Q9DCK3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan4Q9DCK3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan4Q9DCK3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tspan4Q9DCK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tspan4Q9DCK3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan4Q9DCK3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms