Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS2

Tprg1l, Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1lQ9DBS2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1lQ9DBS2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tprg1lQ9DBS2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1lQ9DBS2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1lQ9DBS2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1lQ9DBS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tprg1lQ9DBS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tprg1lQ9DBS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tprg1lQ9DBS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tprg1lQ9DBS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tprg1lQ9DBS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tprg1lQ9DBS2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tprg1lQ9DBS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms