Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calr3Q9D9Q6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calr3Q9D9Q6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calr3Q9D9Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calr3Q9D9Q6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Calr3Q9D9Q6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr3Q9D9Q6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr3Q9D9Q6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr3Q9D9Q6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Calr3Q9D9Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calr3Q9D9Q6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calr3Q9D9Q6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms