Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700123K08RikQ9D991 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700123K08RikQ9D991 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
1700123K08RikQ9D991 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
1700123K08RikQ9D991 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700123K08RikQ9D991 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
1700123K08RikQ9D991 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700123K08RikQ9D991 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
1700123K08RikQ9D991 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
1700123K08RikQ9D991 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
1700123K08RikQ9D991 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700123K08RikQ9D991 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700123K08RikQ9D991 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700123K08RikQ9D991 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
1700123K08RikQ9D991 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700123K08RikQ9D991 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
1700123K08RikQ9D991 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
1700123K08RikQ9D991 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
1700123K08RikQ9D991 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms