Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e2Q9D902 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e2Q9D902 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2Q9D902 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e2Q9D902 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e2Q9D902 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e2Q9D902 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e2Q9D902 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms