Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P3

Krtap4-13, Keratin-associated protein 4-13, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap4-13Q9D7P3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap4-13Q9D7P3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Krtap4-13Q9D7P3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap4-13Q9D7P3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap4-13Q9D7P3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap4-13Q9D7P3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap4-13Q9D7P3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap4-13Q9D7P3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap4-13Q9D7P3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap4-13Q9D7P3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap4-13Q9D7P3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms