Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4X6

Samt4, Spermatogenesis-associated multipass transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt4Q9D4X6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samt4Q9D4X6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Samt4Q9D4X6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samt4Q9D4X6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samt4Q9D4X6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samt4Q9D4X6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samt4Q9D4X6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samt4Q9D4X6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samt4Q9D4X6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samt4Q9D4X6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samt4Q9D4X6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms