Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Katnal2Q9D3R6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Katnal2Q9D3R6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Katnal2Q9D3R6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Katnal2Q9D3R6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Katnal2Q9D3R6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Katnal2Q9D3R6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Katnal2Q9D3R6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Katnal2Q9D3R6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Katnal2Q9D3R6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Katnal2Q9D3R6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms