Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
D930007J09RikQ9D2K6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
D930007J09RikQ9D2K6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
D930007J09RikQ9D2K6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D930007J09RikQ9D2K6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
D930007J09RikQ9D2K6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
D930007J09RikQ9D2K6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
D930007J09RikQ9D2K6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
D930007J09RikQ9D2K6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D930007J09RikQ9D2K6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
D930007J09RikQ9D2K6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
D930007J09RikQ9D2K6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
D930007J09RikQ9D2K6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
D930007J09RikQ9D2K6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
D930007J09RikQ9D2K6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
D930007J09RikQ9D2K6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D930007J09RikQ9D2K6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
D930007J09RikQ9D2K6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
D930007J09RikQ9D2K6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
D930007J09RikQ9D2K6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D930007J09RikQ9D2K6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D930007J09RikQ9D2K6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D930007J09RikQ9D2K6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D930007J09RikQ9D2K6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
D930007J09RikQ9D2K6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D930007J09RikQ9D2K6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
D930007J09RikQ9D2K6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
D930007J09RikQ9D2K6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms