Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc6bQ9D289 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc6bQ9D289 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc6bQ9D289 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc6bQ9D289 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc6bQ9D289 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc6bQ9D289 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc6bQ9D289 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trappc6bQ9D289 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms