Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2cQ9D1C1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2cQ9D1C1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ube2cQ9D1C1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ube2cQ9D1C1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2cQ9D1C1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2cQ9D1C1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms