Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sugt1Q9CX34 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sugt1Q9CX34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sugt1Q9CX34 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sugt1Q9CX34 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sugt1Q9CX34 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sugt1Q9CX34 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sugt1Q9CX34 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sugt1Q9CX34 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sugt1Q9CX34 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sugt1Q9CX34 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sugt1Q9CX34 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sugt1Q9CX34 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sugt1Q9CX34 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sugt1Q9CX34 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms