Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot11Q9CWN7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot11Q9CWN7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot11Q9CWN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot11Q9CWN7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot11Q9CWN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot11Q9CWN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot11Q9CWN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnot11Q9CWN7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnot11Q9CWN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms