Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
1700029F12RikQ9CRB4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700029F12RikQ9CRB4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700029F12RikQ9CRB4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700029F12RikQ9CRB4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700029F12RikQ9CRB4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
1700029F12RikQ9CRB4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms