Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl28Q9CR40 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klhl28Q9CR40 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl28Q9CR40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhl28Q9CR40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl28Q9CR40 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl28Q9CR40 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl28Q9CR40 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl28Q9CR40 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl28Q9CR40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.4 ms