Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q9CQF4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9CQF4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9CQF4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9CQF4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9CQF4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9CQF4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQF4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9CQF4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CQF4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CQF4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CQF4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9CQF4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms