Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl49Q9CQ40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mrpl49Q9CQ40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mrpl49Q9CQ40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mrpl49Q9CQ40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mrpl49Q9CQ40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mrpl49Q9CQ40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mrpl49Q9CQ40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mrpl49Q9CQ40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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