Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GSX2Q9BZM3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSX2Q9BZM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSX2Q9BZM3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSX2Q9BZM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSX2Q9BZM3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSX2Q9BZM3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSX2Q9BZM3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSX2Q9BZM3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms