Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCO2Q9BYV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCO2Q9BYV7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCO2Q9BYV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCO2Q9BYV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCO2Q9BYV7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCO2Q9BYV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BCO2Q9BYV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCO2Q9BYV7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCO2Q9BYV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms