Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP2-1Q9BYU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
KRTAP2-1Q9BYU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KRTAP2-1Q9BYU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP2-1Q9BYU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1175.3 ms