Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP1M1Q9BXS5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP1M1Q9BXS5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
AP1M1Q9BXS5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP1M1Q9BXS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AP1M1Q9BXS5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP1M1Q9BXS5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP1M1Q9BXS5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP1M1Q9BXS5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP1M1Q9BXS5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP1M1Q9BXS5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP1M1Q9BXS5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP1M1Q9BXS5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP1M1Q9BXS5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP1M1Q9BXS5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms