Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERVK-6Q9BXR3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-6Q9BXR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-6Q9BXR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVK-6Q9BXR3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVK-6Q9BXR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERVK-6Q9BXR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERVK-6Q9BXR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVK-6Q9BXR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVK-6Q9BXR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVK-6Q9BXR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVK-6Q9BXR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-6Q9BXR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVK-6Q9BXR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVK-6Q9BXR3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms