Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CARD11Q9BXL7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CARD11Q9BXL7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARD11Q9BXL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARD11Q9BXL7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARD11Q9BXL7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CARD11Q9BXL7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CARD11Q9BXL7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARD11Q9BXL7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARD11Q9BXL7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARD11Q9BXL7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CARD11Q9BXL7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARD11Q9BXL7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARD11Q9BXL7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARD11Q9BXL7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARD11Q9BXL7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARD11Q9BXL7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CARD11Q9BXL7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARD11Q9BXL7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARD11Q9BXL7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CARD11Q9BXL7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARD11Q9BXL7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARD11Q9BXL7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARD11Q9BXL7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CARD11Q9BXL7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CARD11Q9BXL7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CARD11Q9BXL7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CARD11Q9BXL7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CARD11Q9BXL7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARD11Q9BXL7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARD11Q9BXL7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARD11Q9BXL7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARD11Q9BXL7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARD11Q9BXL7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARD11Q9BXL7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms