Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
YIPF2Q9BWQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
YIPF2Q9BWQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
YIPF2Q9BWQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
YIPF2Q9BWQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
YIPF2Q9BWQ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
YIPF2Q9BWQ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YIPF2Q9BWQ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
YIPF2Q9BWQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms