Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REPIN1Q9BWE0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REPIN1Q9BWE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
REPIN1Q9BWE0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
REPIN1Q9BWE0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REPIN1Q9BWE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
REPIN1Q9BWE0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
REPIN1Q9BWE0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
REPIN1Q9BWE0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms