Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFHD1Q9BUP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFHD1Q9BUP0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFHD1Q9BUP0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFHD1Q9BUP0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD1Q9BUP0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFHD1Q9BUP0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFHD1Q9BUP0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFHD1Q9BUP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFHD1Q9BUP0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFHD1Q9BUP0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFHD1Q9BUP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms