Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM208Q9BTX3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM208Q9BTX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM208Q9BTX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM208Q9BTX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM208Q9BTX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM208Q9BTX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM208Q9BTX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms