Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATG101Q9BSB4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG101Q9BSB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG101Q9BSB4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG101Q9BSB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATG101Q9BSB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG101Q9BSB4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG101Q9BSB4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG101Q9BSB4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms