Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MESP1Q9BRJ9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MESP1Q9BRJ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MESP1Q9BRJ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MESP1Q9BRJ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MESP1Q9BRJ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MESP1Q9BRJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MESP1Q9BRJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MESP1Q9BRJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MESP1Q9BRJ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MESP1Q9BRJ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.1 ms