Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LPIN3Q9BQK8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LPIN3Q9BQK8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LPIN3Q9BQK8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPIN3Q9BQK8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPIN3Q9BQK8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPIN3Q9BQK8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPIN3Q9BQK8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPIN3Q9BQK8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPIN3Q9BQK8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LPIN3Q9BQK8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LPIN3Q9BQK8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LPIN3Q9BQK8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LPIN3Q9BQK8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms