Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rtn4rQ99PI8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4rQ99PI8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4rQ99PI8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rtn4rQ99PI8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rtn4rQ99PI8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rtn4rQ99PI8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rtn4rQ99PI8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rtn4rQ99PI8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rtn4rQ99PI8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rtn4rQ99PI8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtn4rQ99PI8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn4rQ99PI8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms