Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ms4a4dQ99N05 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ms4a4dQ99N05 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ms4a4dQ99N05 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ms4a4dQ99N05 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ms4a4dQ99N05 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ms4a4dQ99N05 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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