Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q99KU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q99KU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q99KU6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q99KU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q99KU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q99KU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q99KU6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q99KU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q99KU6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q99KU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q99KU6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Q99KU6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Q99KU6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q99KU6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q99KU6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q99KU6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q99KU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q99KU6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q99KU6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q99KU6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q99KU6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q99KU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q99KU6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q99KU6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q99KU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q99KU6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q99KU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q99KU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q99KU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q99KU6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q99KU6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q99KU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q99KU6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q99KU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q99KU6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q99KU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q99KU6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q99KU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q99KU6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q99KU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q99KU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q99KU6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q99KU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q99KU6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Q99KU6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q99KU6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q99KU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q99KU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q99KU6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q99KU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q99KU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q99KU6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q99KU6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q99KU6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Q99KU6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q99KU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q99KU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q99KU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q99KU6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q99KU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q99KU6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q99KU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q99KU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q99KU6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q99KU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q99KU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q99KU6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q99KU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q99KU6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q99KU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q99KU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q99KU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q99KU6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q99KU6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q99KU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q99KU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q99KU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q99KU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q99KU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q99KU6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q99KU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q99KU6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q99KU6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q99KU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q99KU6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q99KU6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q99KU6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Q99KU6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q99KU6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q99KU6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q99KU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q99KU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q99KU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms