Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clint1Q99KN9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clint1Q99KN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clint1Q99KN9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clint1Q99KN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clint1Q99KN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clint1Q99KN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clint1Q99KN9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms