Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3GL3Q99963 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GL3Q99963 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GL3Q99963 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3GL3Q99963 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SH3GL3Q99963 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3GL3Q99963 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3GL3Q99963 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms