Protein–RNA interactions for Protein: Q99873

PRMT1, Protein arginine N-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT1Q99873 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRMT1Q99873 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRMT1Q99873 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRMT1Q99873 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRMT1Q99873 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRMT1Q99873 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRMT1Q99873 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRMT1Q99873 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRMT1Q99873 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRMT1Q99873 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRMT1Q99873 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRMT1Q99873 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRMT1Q99873 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRMT1Q99873 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms