Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRRX2Q99811 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRRX2Q99811 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRRX2Q99811 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRRX2Q99811 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRRX2Q99811 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRRX2Q99811 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRRX2Q99811 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRRX2Q99811 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRRX2Q99811 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRRX2Q99811 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRRX2Q99811 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRRX2Q99811 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRRX2Q99811 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRRX2Q99811 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRRX2Q99811 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRRX2Q99811 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRRX2Q99811 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRRX2Q99811 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRRX2Q99811 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRRX2Q99811 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRRX2Q99811 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRRX2Q99811 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRRX2Q99811 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms