Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPAS1Q99742 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS1Q99742 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS1Q99742 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS1Q99742 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPAS1Q99742 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS1Q99742 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS1Q99742 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS1Q99742 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms