Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATXN2Q99700 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN2Q99700 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATXN2Q99700 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATXN2Q99700 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATXN2Q99700 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATXN2Q99700 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATXN2Q99700 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATXN2Q99700 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATXN2Q99700 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATXN2Q99700 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATXN2Q99700 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATXN2Q99700 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATXN2Q99700 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms