Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LGMNQ99538 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LGMNQ99538 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGMNQ99538 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGMNQ99538 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LGMNQ99538 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LGMNQ99538 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LGMNQ99538 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LGMNQ99538 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGMNQ99538 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LGMNQ99538 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGMNQ99538 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LGMNQ99538 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LGMNQ99538 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LGMNQ99538 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LGMNQ99538 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LGMNQ99538 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LGMNQ99538 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGMNQ99538 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LGMNQ99538 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LGMNQ99538 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGMNQ99538 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LGMNQ99538 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LGMNQ99538 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LGMNQ99538 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGMNQ99538 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGMNQ99538 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LGMNQ99538 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LGMNQ99538 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LGMNQ99538 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LGMNQ99538 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LGMNQ99538 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms