Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CsprsQ99388 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CsprsQ99388 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CsprsQ99388 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CsprsQ99388 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CsprsQ99388 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CsprsQ99388 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CsprsQ99388 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CsprsQ99388 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CsprsQ99388 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CsprsQ99388 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CsprsQ99388 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CsprsQ99388 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CsprsQ99388 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CsprsQ99388 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CsprsQ99388 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CsprsQ99388 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CsprsQ99388 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CsprsQ99388 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CsprsQ99388 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CsprsQ99388 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CsprsQ99388 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms