Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SRPK1Q96SB4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRPK1Q96SB4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRPK1Q96SB4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRPK1Q96SB4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRPK1Q96SB4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPK1Q96SB4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SRPK1Q96SB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRPK1Q96SB4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRPK1Q96SB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRPK1Q96SB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms