Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCC1Q96S66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCC1Q96S66 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCC1Q96S66 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLCC1Q96S66 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCC1Q96S66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCC1Q96S66 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCC1Q96S66 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms