Protein–RNA interactions for Protein: Q96QI5

HS3ST6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST6Q96QI5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HS3ST6Q96QI5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS3ST6Q96QI5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HS3ST6Q96QI5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HS3ST6Q96QI5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HS3ST6Q96QI5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HS3ST6Q96QI5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST6Q96QI5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms