Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GCNAQ96QF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCNAQ96QF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GCNAQ96QF7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCNAQ96QF7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNAQ96QF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCNAQ96QF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNAQ96QF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCNAQ96QF7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCNAQ96QF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCNAQ96QF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCNAQ96QF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GCNAQ96QF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GCNAQ96QF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GCNAQ96QF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GCNAQ96QF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms