Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UHRF2Q96PU4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UHRF2Q96PU4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UHRF2Q96PU4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UHRF2Q96PU4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UHRF2Q96PU4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UHRF2Q96PU4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms