Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
LRRC7Q96NW7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
LRRC7Q96NW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
LRRC7Q96NW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
LRRC7Q96NW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
LRRC7Q96NW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
LRRC7Q96NW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
LRRC7Q96NW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
LRRC7Q96NW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
LRRC7Q96NW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
LRRC7Q96NW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC7Q96NW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC7Q96NW7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
LRRC7Q96NW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
LRRC7Q96NW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC7Q96NW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC7Q96NW7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
LRRC7Q96NW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC7Q96NW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
LRRC7Q96NW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
LRRC7Q96NW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC7Q96NW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC7Q96NW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC7Q96NW7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC7Q96NW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
LRRC7Q96NW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRC7Q96NW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
LRRC7Q96NW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
LRRC7Q96NW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
LRRC7Q96NW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
LRRC7Q96NW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LRRC7Q96NW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
LRRC7Q96NW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms