Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD6Q96NE9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMD6Q96NE9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMD6Q96NE9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FRMD6Q96NE9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMD6Q96NE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FRMD6Q96NE9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms